1.实验室超纯水避免与环境接触
超纯水取水后很容易遭到环境污染，所以使用前取水（即取即用）方式是较合适的。只有把超纯水与环境接触的时间缩到极短，才能够获得纯度*的超纯水。
2.不要长时间在储水桶中存放
在配置高纯度的化学试剂时，尽量不要使用长时间储水桶中存放的超纯水，因为储水桶经长时间使用后，会因杂质、微生物的污染而造成水质的劣化，像这种水，再使用时已经不再是超纯水。
3.超纯水避免日光直射
储水桶请勿放置在日光直射处，水温上升，容易造成微生物繁殖。特别是半透明储水桶，也会因为日光通透而造成藻类繁殖。
4.取水要放掉初期的水
超纯水取水时一定要将初期的出水放掉，以获得稳定的水质。
5.取水顺容器侧壁流入
取水时让超纯水顺着容器侧壁流入，尽量不要让气泡产生，可降低空气污染。
6.不要在终端滤器连接软管
请不要在终端滤器后再连接软管，使用直接取水的方式才能获得纯度高的超纯水。
7.不用水时把水桶中的水全都放掉
长时间不用水时，应将压力储水桶中的超纯水全部放掉以防止污染。
8.长时间不使用把初期超纯水放掉
超纯水机若长时间不使用，再次使用时应把初期超纯水充分放掉以确保水质。
9.超纯水机保持至少每7-10天通水一次
原则上，超纯水机应至少每7—10天通水一次，以防止微生物污染