1、膜组件的更换。超纯水系统中的超滤膜组件的使用寿命是由产品质量、运行条件等因素来决定的，一般来讲，反洗频率、化学清洗频率等对使用寿命有较大的影响。

2、控制系统和阀门容易受到损坏。因为设备在长期运行之后会产生一些物质，所以需频繁的反洗，不过超滤装置的阀门容易损坏。因此，对于使用次数较多的阀门其质量要高；

3、容易造成断丝。因为大部分的超滤设备材料采用的是中空纤维丝，在运行的过程中因为膜丝震动太大容易出现断丝的现象。断丝以后会引起水质量的变化，所以应迅速确定断丝的准确位置，采取相应的措施。对断丝的处理一般的找出破损的膜丝，进行封堵或者更换新元件。

4、出现污堵现象。在运行过程中，膜出现污堵是常见的现象，污堵的速度、化学清洗后的恢复率，决定着超滤能否使用。通过实验来选择超滤膜的种类、运行方式，并对其反洗工艺、杀菌工艺和化学清洗工艺进行实验，找到减缓超滤膜通量下降的方法，并对不可逆污堵的情况进行预测。